葉緑体全遺伝子体非「固定設計図」

Eranga Pawani Witharana為第一著者。本研究班明葉緑体全遺伝子体於数千万年間緩徐且連続変構造。

葉緑体全遺伝子体及structural heteroplasmy

植物細胞除核DNA外、葉緑体亦有固有全遺伝子体。従来以其比較的小且構造安定、故広用於植物系統進化研究。

葉緑体DNA多copy於細胞内、核遺伝子座之copy比較的少。此多copy性、関係異構造不即固定於一方而共存同一個体之可能。然核DNA copy数随倍数性・細胞周期・組織等而変、故不可一概称毎細胞二copy。

進化時間尺度上構造変化

本研究解析柑橘亜科28種、示53-bp短逆向反復配列（sIRs）間之分子内相同組換、使葉緑体large single-copy（LSC）領域生約22-kb逆位。同一個体内二構造型共存之状態、称structural heteroplasmy。

二構造型存於複数種、歴約12.1–28.2 million years。少数型於一部系統成多数型之pattern、合遺伝的浮動関与。此示葉緑体構造進化非瞬時固定、乃継続且漸進之過程。

低頻度全遺伝子体構造検出

解析検出跨構造境界之discordant paired-end reads及soft-clipped reads。又以PCR検証、確認低頻度構造型実在、非sequencing又非mapping由来artifact。

論文発表及媒体報道

• 佐賀大学 新聞発表
• 鹿児島大学 新聞発表
• 鹿児島大学大学院連合農学研究科webpage

雖無online記事、本研究見介於2026年4月20日付南日本新聞。