Xloroplast genomlari “o‘zgarmas loyiha” emas
Eranga Pawani Witharana xonim birinchi muallif sifatida ishlagan holda, bizning laboratoriyamizda joylashgan tadqiqot guruhi xloroplast genomlari o'n millionlab yillar davomida sekin, ammo uzluksiz strukturaviy o'zgarishlarga uchraganligini aniqladi.
Asl tadqiqot maqolasi haqida ma’lumot
Sarlavha: Ongoing structural changes highlight the dynamic nature of chloroplast genomes
Mualliflar: Eranga Pawani Witharana, Nobuhiro Kotoda, Kiyohiko Seki, Shinji Fukuda & Yukio Nagano
Jurnal: Nucleic Acids Research, Volume 54, Issue 4, gkag117
Nashr etilgan sana: February 24, 2026
DOI: 10.1093/nar/gkag117
Jurnal ko‘rsatkichlari: 2025 Journal Impact Factor: 15.0; 2025 5-year Journal Impact Factor: 17.6; JCR Biochemistry & Molecular Biology: 14/328; 2025 CiteScore: 29.8; Scopus Genetics: 5/357 (Top 1.4%); 2025 SNIP: 5.1 (2026-yil iyul holatiga ko‘ra nashriyot e’lon qilgan eng so‘nggi ko‘rsatkichlar)
Maqola turi: Open Access
- 28 ta Aurantioideae turini tahlil qilish natijasida strukturaviy geteroplazmiya aniqlandi - bir xil o'simlik ichida ikkita strukturaviy jihatdan farq qiluvchi xloroplast genomlarining birga yashashi.
- Qisqa teskari takrorlanishlar vositasida rekombinatsiya taxminan 22 kb katta inversiya hosil qiladi.
- Muqobil genom konfiguratsiyalari taxminan 12,1–28,2 million yil avval, Miosenning dastlabki davridan beri saqlanib qolgan ko'rinadi.
- Tadqiqot standart qisqa o'qish ma'lumotlaridan hatto past chastotali xloroplast genom konfiguratsiyalarini ham aniqlash uchun amaliy ish jarayonini taqdim etadi.
Xloroplast genomlari va strukturaviy geteroplazmiya
O'simlik hujayralari yadro DNA dan tashqari xloroplastlarda mustaqil genomga ega. Xloroplast genomlari nisbatan kichik va ko'pincha strukturaviy jihatdan barqaror deb hisoblanganligi sababli, ular o'simlik filogeniyasi va evolyutsiyasini o'rganishda keng qo'llaniladi.
Xloroplast DNA hujayrada ko‘p nusxada bo‘ladi, yadro lokuslari esa nisbatan kam nusxaga ega. Bu farq muqobil xloroplast genom konfiguratsiyalarining bir individda birga mavjud bo‘lishiga, ya’ni konfiguratsiyalardan biri darhol fiksatsiyalanib qolmasligiga imkon berishi mumkin. Ploidiya, hujayra sikli va to‘qima holati nusxalar sonini o‘zgartirishi mumkinligi sababli, yadro DNA har bir hujayrada doimo ikki nusxada bo‘ladi deb ta’riflanmasligi kerak.
Evolyutsion vaqt davomida strukturaviy o'zgarish
Tadqiqotda Aurantioideae guruhining 28 turi tahlil qilindi va uzunligi 53 bp bo‘lgan bir juft qisqa teskari takror (sIR) orasidagi molekula ichidagi gomologik rekombinatsiya xloroplastning katta bir nusxali (LSC) hududida taxminan 22 kb inversiyani hosil qilishi ko‘rsatildi. Bir individda ikki strukturaviy konfiguratsiyaning birga mavjudligi strukturaviy geteroplazmiya deyiladi.
Ikki konfiguratsiya taxminan 12,1–28,2 million yil davomida bir nechta turlarda saqlanib qolgan va bu Miosenning dastlabki davrigacha davom etgan. Ba'zi nasllarda kichik izoform dominant bo'lib qolgan naqshlar genetik driftning mumkin bo'lgan roliga mos keladi. Topilmalar plastoma strukturaviy evolyutsiyasini bir zumda o'zgarmas holatlar ketma-ketligi emas, balki doimiy, bosqichma-bosqich jarayon sifatida ko'rsatadi.
Noyob genom konfiguratsiyalarini aniqlash
Tahlil strukturaviy uzilish nuqtalarini qamrab oluvchi nomuvofiq juftlashgan uchli o'qishlar va yumshoq qirqilgan o'qishlarni aniqladi. PCR tekshiruvi shuni ko'rsatdiki, past chastotali konfiguratsiyalar haqiqiy va shunchaki ketma-ketlik yoki xaritalash artefaktlari emas.
Nashr va ommaviy axborot vositalarida yoritish
- Saga University press release
- Kagoshima University press release(Japanese/English PDF)
- Kagoshima universitetining Qishloq xo‘jaligi fanlari birlashgan oliy maktabi veb-sahifasi
Onlayn maqola mavjud bo'lmasa-da, tadqiqot 2026-yil 20-aprelda Minami-Nippon gazetasida ham chop etilgan.