ক্লোরোপ্লাস্ট জিনোম কোনো “স্থির নকশা” নয়

মিস. Eranga Pawani Witharana প্রথম লেখক হিসাবে, আমাদের গবেষণাগারে কেন্দ্রীভূত একটি গবেষণা গোষ্ঠী প্রকাশ করেছে যে ক্লোরোপ্লাস্ট জিনোমগুলি কয়েক মিলিয়ন বছর ধরে ধীর কিন্তু অবিচ্ছিন্ন কাঠামোগত পরিবর্তনের মধ্য দিয়ে গেছে।

শুধুমাত্র জাপানি, ইংরেজি ও সিংহলি ভাষার বিষয়বস্তু মানুষের দ্বারা পর্যালোচিত হয়েছে।

মূল গবেষণা নিবন্ধের তথ্য

শিরোনাম: Ongoing structural changes highlight the dynamic nature of chloroplast genomes

লেখকবৃন্দ: Eranga Pawani Witharana, Nobuhiro Kotoda, Kiyohiko Seki, Shinji Fukuda & Yukio Nagano

সাময়িকী: Nucleic Acids Research, খণ্ড ৫৪, সংখ্যা ৪, gkag117

প্রকাশিত: ২৪ ফেব্রুয়ারি ২০২৬

DOI: 10.1093/nar/gkag117

সাময়িকীর সূচক: 2025 Journal Impact Factor: 15.0; 2025 5-year Journal Impact Factor: 17.6; JCR Biochemistry & Molecular Biology: 14/328; 2025 CiteScore: 29.8; Scopus Genetics: 5/357 (Top 1.4%); 2025 SNIP: 5.1 (জুলাই ২০২৬ পর্যন্ত প্রকাশকের তালিকাভুক্ত সর্বশেষ সূচক)

নিবন্ধের ধরন: ওপেন অ্যাক্সেস (Open Access)

মূল অনুসন্ধান

28 টি Aurantioideae প্রজাতির একটি বিশ্লেষণে স্ট্রাকচারাল হেটেরোপ্লাজমি সনাক্ত করা হয়েছে—একই উদ্ভিদের মধ্যে দুটি গঠনগতভাবে স্বতন্ত্র ক্লোরোপ্লাস্ট জিনোমের সহাবস্থান।
সংক্ষিপ্ত উল্টানো পুনরাবৃত্তির মধ্যস্থতায় পুনঃসংযোগ আনুমানিক 22 kb এর একটি বৃহৎ ইনভার্সন তৈরি করে।
বিকল্প জিনোম কনফিগারেশন প্রায় 12.1-28.2 মিলিয়ন বছর আগে, প্রাথমিক মায়োসিন থেকে অব্যাহত ছিল বলে মনে হয়।
স্ট্যান্ডার্ড শর্ট-রিড ডেটা থেকে এমনকি কম-ফ্রিকোয়েন্সি ক্লোরোপ্লাস্ট জিনোম কনফিগারেশন সনাক্ত করার জন্য গবেষণাটি একটি ব্যবহারিক কর্মপ্রবাহ উপস্থাপন করে।

ক্লোরোপ্লাস্ট জিনোম এবং স্ট্রাকচারাল হেটেরোপ্লামি

উদ্ভিদ কোষে পারমাণবিক DNA ছাড়াও ক্লোরোপ্লাস্টে একটি স্বাধীন জিনোম থাকে। যেহেতু ক্লোরোপ্লাস্ট জিনোমগুলি তুলনামূলকভাবে ছোট এবং প্রায়শই কাঠামোগতভাবে স্থিতিশীল হিসাবে বিবেচিত হয়, সেগুলি উদ্ভিদের ফিলোজেনি এবং বিবর্তনের গবেষণায় ব্যাপকভাবে ব্যবহৃত হয়।

ক্লোরোপ্লাস্ট DNA একটি কোষের মধ্যে উচ্চ কপি নম্বরে ঘটে, যেখানে নিউক্লিয়ার লোকি তুলনামূলকভাবে কম-কপি হয়। এই পার্থক্যটি বিকল্প ক্লোরোপ্লাস্ট জিনোম কনফিগারেশনগুলিকে অবিলম্বে স্থির হওয়ার পরিবর্তে একজন ব্যক্তির মধ্যে সহাবস্থান করার অনুমতি দিতে পারে। নিউক্লিয়ার DNA কে প্রতি কক্ষে দুটি কপি হিসাবে বর্ণনা করা উচিত নয় কারণ প্লোইডি, কোষ চক্র এবং টিস্যু অবস্থা অনুলিপি সংখ্যা পরিবর্তন করতে পারে।

বিবর্তনীয় সময় জুড়ে কাঠামোগত পরিবর্তন

গবেষণায় 28 টি Aurantioideae প্রজাতি বিশ্লেষণ করা হয়েছে এবং দেখা গেছে যে 53-bp শর্ট ইনভার্টেড রিপিটস (sIRs) এর একটি জোড়ার মধ্যে ইন্ট্রামলিকুলার হোমোলোগাস পুনর্মিলন ক্লোরোপ্লাস্ট বড় একক অঞ্চলে প্রায় 22-kb ইনভার্সন তৈরি করে। একজন ব্যক্তির মধ্যে দুটি কাঠামোগত কনফিগারেশনের সহাবস্থানকে স্ট্রাকচারাল হেটেরোপ্লাজমি বলা হয়।

দুটি কনফিগারেশন প্রায় 12.1-28.2 মিলিয়ন বছর ধরে একাধিক প্রজাতি জুড়ে রক্ষণাবেক্ষণ করা হয়েছিল, যা প্রারম্ভিক মায়োসিন পর্যন্ত প্রসারিত হয়েছিল। যে নিদর্শনগুলিতে একটি ছোট আইসোফর্ম কিছু বংশে প্রভাবশালী হয়ে ওঠে তা জেনেটিক প্রবাহের সম্ভাব্য ভূমিকার সাথে সামঞ্জস্যপূর্ণ। ফলাফলগুলি প্লাস্টোমের কাঠামোগত বিবর্তনকে তাত্ক্ষণিকভাবে স্থির অবস্থার উত্তরাধিকারের পরিবর্তে একটি চলমান, ধীরে ধীরে প্রক্রিয়া হিসাবে দেখায়।

বিরল জিনোম কনফিগারেশন সনাক্ত করা হচ্ছে

বিশ্লেষণে স্ট্রাকচারাল ব্রেকপয়েন্ট বিস্তৃত বিরোধপূর্ণ পেয়ারড-এন্ড রিড এবং সফট-ক্লিপড রিড সনাক্ত করা হয়েছে। PCR বৈধতা আরও দেখিয়েছে যে কম-ফ্রিকোয়েন্সি কনফিগারেশনগুলি প্রকৃত ছিল এবং নিছক সিকোয়েন্সিং বা ম্যাপিং শিল্পকর্ম নয়।

প্রকাশনা এবং মিডিয়া কভারেজ

যদিও কোন অনলাইন নিবন্ধ পাওয়া যায় না, 20 এপ্রিল, 2026-এ গবেষণাটি মিনামি-নিপ্পন সংবাদপত্রেও প্রদর্শিত হয়েছিল।

জাপানি ভাষায় পড়ুন → ইংরেজিতে পড়ুন → সর্বশেষ গবেষণায় ফিরে যান