Notre philosophie

« 民以食為天 » (« Pour le peuple, se nourrir est la première nécessité ») — L’alimentation est le fondement qui soutient la vie et bâtit la société.
Nous en explorons l’essence par la science.

Introduction à notre laboratoire

Nous abordons les ingrédients alimentaires d’un point de vue chimique, tant dans l’éducation que dans la recherche. S’appuyant sur notre travail d’identification des enzymes dégradant les glucides et leur application aux ingrédients alimentaires, ainsi que sur l’avancement de la chimie alimentaire par la génomique, nous intégrerons les modèles de langage génomiques, protéiques et chimiques dans la science alimentaire. En reliant les informations biologiques et moléculaires entre ingrédients alimentaires, plantes et micro-organismes, nous visons à accélérer la découverte et l’application d’enzymes, de micro-organismes, de ressources végétales et de composants présents dans les ingrédients alimentaires — et ainsi à stimuler l’innovation en science alimentaire.

Intégration des informations DNA, protéiniques et chimiques à l’aide de plantes, de micro-organismes et d’ingrédients alimentaires

Aux États-Unis, l’utilisation croissante de médicaments anti-obésité a accru l’intérêt pour les aliments riches en nutriments capables de fournir des nutriments essentiels même lorsque l’apport total est réduit. En revanche, le marché de ces aliments reste limité au Japon. Cependant, la sous-nutrition associée au vieillissement de la population, le faible poids corporel chez les jeunes femmes et l’adoption probable de médicaments anti-obésité rendront les défis nutritionnels typiques des pays développés de plus en plus importants au Japon. Dans ce contexte, nous faisons progresser la recherche sur les aliments riches en nutriments. Nori et natto, que nous avons étudiés en profondeur, comptent parmi les sujets les plus prometteurs de cette recherche.

Les aliments riches en nutriments incluent le nori, le natto, les céréales et les légumes à feuilles

Membres

Corps enseignant

Étudiants diplômés

Chercheur invité

Étudiants de premier cycle

Dernières recherches

Études présentées dans les communiqués de presse

Opportunités de recherche collaborative

Les méthodes de recherche que nous avons développées et publiées intègrent l’analyse génomique et l’évaluation fonctionnelle, en se concentrant sur les micro-organismes liés aux aliments. À partir de données de séquençage de nouvelle génération (NGS), nous analysons au niveau moléculaire les groupes de gènes et les caractéristiques métaboliques impliqués dans la production et la fermentation des aliments. Nous développons également une méthode d’analyse du pangénome pour les micro-organismes eucaryotes et avons publié le programme EukPan dans le dépôt GitHub yukio-nagano/eukpan. Grâce à ces approches, nous invitons les chercheurs du Japon et de l’étranger à collaborer à des projets de science des aliments, de la recherche fondamentale à la recherche appliquée.

En postulant Les méthodes de recherche que nous avons développées et publiées, il est possible de préparer et de publier des articles académiques sur le l’évolution des animaux et des plantes en utilisant uniquement des données publiques. Nous mènent déjà des recherches collaboratives avec des chercheurs en Inde En utilisant cette approche, je cherche maintenant un petit nombre de partenaires supplémentaires, tant au Japon qu’à l’étranger, afin de faire progresser davantage cette recherche. Candidats sont tenus de pouvoir communiquer en anglais et d’avoir accès à un ordinateur qui tourne Linux.

Événements et mises à jour

7 au 13 septembre 2026 Nous avons organisé un Sakura Science Exchange Program. Un membre du corps enseignant et sept étudiants de premier cycle de la Sri Vishnu Educational Society, en Inde, se sont rendus au Japon. Le 21 août 2026, nous avons publié un communiqué de presse préalable.
2 septembre 2026Aujourd’hui, nous avons adopté ChatGPT Business, une offre conçue pour les équipes telles que les laboratoires de recherche. Son coût pouvant être pris en charge par des crédits de recherche, nous mettrons cet outil d’IA avancé à la disposition d’étudiants de master et de doctorat particulièrement talentueux et motivés, afin d’accélérer encore nos travaux. Notre laboratoire continuera d’investir activement dans les étudiants d’excellence.
24 août 2026L’Université de Peradeniya (University of Peradeniya) a distingué notre article suivant dans la catégorie Q1 Journal Publications.
Subfamily evolution analysis using nuclear and chloroplast data from the same reads
Eranga Pawani Witharana, Takaya Iwasaki, Myat Htoo San, Nadeeka U. Jayawardana, Nobuhiro Kotoda, Masashi Yamamoto & Yukio Nagano
Scientific Reports 15, Article number: 687 (2025).
Une part importante de cette étude a été réalisée à l’Université de Peradeniya, au Sri Lanka. À l’époque, Yukio Nagano soutenait à distance, depuis le Japon, les recherches d’Eranga Pawani Witharana. Celle-ci a ensuite obtenu une bourse du gouvernement japonais (MEXT), transféré ses activités de recherche au Japon, poursuivi le travail et l’a achevé sous la forme de cet article. Ce travail constitue donc aussi clairement un résultat des activités de recherche menées à l’Université de Peradeniya. La Dr Nadeeka U. Jayawardana a assisté à la cérémonie au nom de notre groupe de recherche. Nous sommes très heureux que l’Université de Peradeniya ait reconnu ainsi cette réalisation scientifique.
20 août 2026 Yukio Nagano et ses collègues ont publié l’article « Human-mediated domestic translocation disrupts regional phylogeographic structure of the Genji firefly (Nipponoluciola cruciata) in urban Tokyo » dans Conservation Genetics. L’étude montre que la translocation domestique d’origine humaine a perturbé la structure phylogéographique régionale des populations de lucioles Genji dans la zone urbaine de Tokyo. Ce travail a été coécrit avec le Dr Hirobumi Suzuki, l’un des principaux experts japonais de la recherche et de la conservation des lucioles. Le 8 septembre 2026, l’université Meisei, l’Université chrétienne internationale, l’université de Kagoshima et l’université de Saga ont publié un communiqué de presse conjoint (informations disponibles uniquement en japonais).
30 mars 2026 Un projet conjoint dirigé par Yukio Nagano en tant que coordinateur principal japonais et Dr Samudrala Pavan Kumar en tant que coordinateur principal indien était Sélectionné pour le Programme Inde–Japon de Circulation des Jeunes Talentueux en Sciences (LOTUS Programme). Le Dr Kumar est affilié à Shri Vishnu College of Pharmacy (SVCP) sous le Sri Vishnu Educational Society. Grâce à ce projet, Mme Durga Bhavani Koruprolu du SVCP restera dans notre laboratoire en tant que chercheuse invitée pendant environ un an à partir d’aujourd’hui. Comme de nombreux projets sélectionnés impliquent les Indian Institutes of Technology, cette sélection est une reconnaissance particulièrement remarquable de la qualité de notre cadre de recherche et de la collaboration internationale.
26 mars 2026 Seki et Nagano ont exposé à la SAGA TSUNAGI Convention(en japonais).
5 mars 2026 Nagano et ses collègues ont fondé Smart Review Technologies Co., Ltd., et Nagano est devenu administrateur de la société.
24 février 2026 Avec Mme Eranga Pawani Witharana comme première auteure, un groupe de recherche centré dans notre laboratoire a publié l’article collaboratif «Ongoing structural changes highlight the dynamic nature of chloroplast genomes« dans Nucleic Acids Research [Métriques de la revue : Journal Impact Factor 2025 : 15,0 ; 2025 Journal Impact Factor 5 ans : 17,6 ; JCR Biochimie & Biologie moléculaire : 14/328 ; CiteScore 2025 : 29,8 ; Scopus Genetics : 5/357 (Top 1,4 %) ; SNIP 2025 : 5.1 (dernières métriques répertoriées par l’éditeur en juillet 2026)]. Les informations ont été diffusées via un Saga University press release, a Kagoshima University press release(Japanese/English PDF), et un Page de l’École doctorale unifiée des sciences agricoles de l’Université de Kagoshima. Bien qu’aucun article en ligne ne soit disponible, cet ouvrage a été publié dans le journal Minami-Nippon le 20 avril 2026.
Du 2 au 13 février 2026 Nous avons accueilli le Sakura Science Exchange Program. Quatre participants de la Sri Vishnu Educational Society en Inde et quatre participants de Université Tribhuvan au Népal, il a visité le Japon. De plus, le Dr Raju AEDLA, responsable du Centre de la Vishnu Japan Outreach Centre sous la Sri Vishnu Educational Society en Inde, a visité le Japon séparément du programme scientifique Sakura.
Saga University délivré Un communiqué de presse(en japonais) à l’avance, et le gouvernement préfectoral de Saga a été libéré Un communiqué de presse distinct(en japonais) concernant la visite de courtoisie du gouverneur de la préfecture de Saga le 9 février. Reflétant leurs différents rôles, le Bureau international de planification de l’Université et Nagano ont chacun publié un rapport post-programme (le Anciens et le Dernière, respectivement).
17 décembre 2025 Seki et Nagano ont publié l’article cosigné « Conserved accessory genes link a phylogenetically distinct Bacillus subtilis strain from Indian bekang to the Japanese natto clade » dans Scientific Reports. [Indicateurs de la revue : Journal Impact Factor 2025 : 4,9 ; Journal Impact Factor 5 ans 2025 : 4,8 ; SNIP 2025 : 1,339 ; SJR 2025 : 0,893 ; La deuxième revue la plus citée au monde (dernières valeurs indiquées par l’éditeur en juillet 2026)]. Nagano a également écrit un article sur le contexte de la recherche, et Saga University a publié un English-language press release. La photographie de la première page peut être identifiée comme du « natto » par une recherche d’images, mais elle montre en réalité du Bekang. L’étude a été présentée dans le journal Saga(en japonais) le 14 janvier 2026 et dans le numéro de mars 2026 de Kodomo no Kagaku(en japonais), paru le 10 février 2026.
2 au 5 décembre 2025 Eranga Pawani Witharana a donné un séminaire le 2 décembre dans Dr. Takaya Iwasaki’s laboratory à la Faculté des sciences de l’Université d’Ochanomizu, puis a présenté une affiche lors de la réunion annuelle de la Molecular Biology Society of Japan, organisée à Pacifico Yokohama du 3 au 5 décembre.
21 octobre 2025 L’entretien avec Nagano a été publié à la page 7 du numéro de juillet 2025 de Vishnu Era – SVES Quarterly News Magazine.
Du 18 au 29 septembre 2025 Pour conclure un accord d’échange académique entre la Faculté de l’Agriculture, de l’Saga University et de la Vishnu Japan Outreach Centre sous le Sri Vishnu Educational Society en Inde, Nagano a visité l’Inde avec le doyen Suzuki de la faculté de l’agriculture. Pour plus de détails, veuillez consulter le press release. Au cours de la visite, des recherches conjointes ont également été menées avec des membres de la Équipe de recherche indienne. Cette photo montre le tout nouveau Centre de recherche sur le génome des plantes.
19 août 2025 Nagano et ses collègues ont publié l’article co-écrit «Exploration de la diversité génétique et de la structure des populations de poulets indigènes du Myanmar en utilisant le séquençage de DNA à double restriction de restriction au site« dans Animal Genetics [Métriques de la revue : Journal Impact Factor : 2,2 ; CiteScore : 4,0 (dernières métriques répertoriées par l’éditeur en juillet 2026)]. La première auteure est le Dr Su Lai Yee Mon. Elle est restée à Saga University du 29 septembre au 3 octobre 2020, période durant laquelle il a effectué une partie de L’analyse des données pour cette étude.
1er juillet 2025 Nagano a été nommé professeur invité au Vishnu Institute of Pharmaceutical Education & Research (Narsapur, Telangana, India) et au Shri Vishnu College of Pharmacy (Bhimavaram, Andhra Pradesh, India). Ces nominations de trois ans courent jusqu’au 30 juin 2028. Nous mènerons conjointement des recherches sur les plantes médicinales.
29 mai 2025 Nagano a reçu deux distinctions lors des Springer Nature Editor of Distinction Awards 2025 : Editorial Contribution Award for contributions to Scientific Reports et Author Service Award for contributions to Scientific Reports. Saga University a publié un communiqué de presse le 10 juin.
23 mai 2025 Seki et Nagano ont publié l’article «Draft genome sequence of Agarivorans albus strain S3 capable of utilizing nori as a nutrient source« dans Microbiology Resource Announcements. C’est leur premier article de recherche commun de notre laboratoire.
16 mai 2025 Un article de journal sur notre collaborateur, M. Fukuda(en japonais), a été publiée. Il a obtenu son diplôme du lycée Chienkan en mars 2025 et prévoyait de s’inscrire à l’Université de Washington cet automne-là.
12 mai 2025 Nous avons publié l’article «Metagenomic analysis reveals fuzzy bacterial communities potentially supporting Pyropia yezoensis through vitamin B12 and indole acetic acid biosynthesis« dans Phycological Research [Métriques de la revue : Journal Impact Factor : 1,0 ; CiteScore : 3.3 (dernières métriques répertoriées par l’éditeur en juillet 2026)]. La première auteure est la Dre Yukino Mizutani, qui était auparavant chez Saga University et mène actuellement des recherches à l’Université de Mie.
21 avril 2025 Selon Google Scholar, Les publications de Nagano dépassèrent les 3 000 citations.
10 avril 2025 Nous avons publié l’article «Identification of new resistance QTL regions in loquat cultivar ‘Champagne’ against Pseudomonas syringae pv. eriobotryae group C« dans Tree Genetics & Genomes [Métriques de la revue : 2025 Journal Impact Factor : 2,1 ; Journal Impact Factor 5 ans 2025 : 2,1 (dernières métriques répertoriées par l’éditeur en juillet 2026)]. Le premier auteur est M. Shogo Koga, co-supervisé par le Dr Shinji Fukuda et le Dr Nagano.
7 avril 2025 M. Shogo Koga, codirigé par le Dr Shinji Fukuda et le Dr Nagano, a reçu le Prix de la meilleure présentation décerné à un jeune chercheur lors de la réunion de printemps FY2025 de la Japanese Society for Horticultural Science(en japonais). Il recevait ce prix pour la deuxième année consécutive.
1er avril 2025 Yukio Nagano a rejoint notre laboratoire depuis le Saga University’s Analytical Research Center for Experimental Sciences(en japonais). Mme Eranga Pawani Witharana (Sri Lanka) a intégré un programme doctoral. La Dre Myat Htoo San (Myanmar), qui a obtenu son doctorat pendant l’exercice 2024 sous la direction du Dr Nagano au Saga University’s Analytical Research Center for Experimental Sciences(en japonais), a rejoint le National Institute of Advanced Industrial Science and Technology en tant que chercheuse permanente à temps plein. Le Dr Takehito Inaba, encadré par le Dr Nagano à la Faculté d’agriculture de l’Université de Nagoya, a été nommé professeur à la Faculté d’agriculture de l’Université de Miyazaki.
Illustration de portrait du professeur Yukio Nagano

Yukio Nagano