Felsefemiz
Biz onun özünü bilim yoluyla araştırıyoruz.
Laboratuvarımıza Giriş
Gıda bileşenlerine hem eğitimde hem de araştırmada kimyasal bir bakış açısıyla yaklaşıyoruz. Karbonhidratı parçalayan enzimleri tanımlama ve bunları gıda içeriklerine uygulama konusundaki çalışmalarımızın yanı sıra genom bilimi yoluyla gıda kimyasını ilerletme çalışmalarımıza dayanarak genom, protein ve kimyasal dil modellerini gıda bilimine entegre edeceğiz. Gıda içerikleri, bitkiler ve mikroorganizmalar arasındaki biyolojik ve moleküler bilgileri birbirine bağlayarak, enzimlerin, mikroorganizmaların, bitki kaynaklarının ve gıda içeriklerinde bulunan bileşenlerin keşfedilmesini ve uygulanmasını hızlandırmayı ve böylece gıda biliminde yenilikçiliği teşvik etmeyi amaçlıyoruz.
Amerika Birleşik Devletleri'nde obezite karşıtı ilaçların artan kullanımı, genel gıda alımı azaltıldığında bile temel besin maddelerini sağlayabilen, besin açısından yoğun gıdalara olan ilgiyi artırdı. Buna karşılık Japonya'da bu tür gıdaların pazarı sınırlı kalıyor. Bununla birlikte, nüfusun yaşlanmasıyla ilişkili yetersiz beslenme, genç kadınlar arasında düşük vücut ağırlığı ve obezite karşıtı ilaçların muhtemelen daha yaygın olarak benimsenmesi, gelişmiş ülkelerdeki tipik beslenme zorluklarını Japonya'da giderek daha önemli hale getirecek. Bu çerçevede, besin açısından yoğun gıdalara yönelik araştırmalarımızı ilerletiyoruz. Kapsamlı olarak incelediğimiz Nori ve natto bu araştırmanın en umut verici konuları arasında yer alıyor.
Potansiyel uluslararası öğrenciler için
Üyeler
Fakülte
-
Yukio Nagano
- Saga Üniversitesi Ziraat Fakültesinde profesör
- Uygulamalı Biyokimya ve Gıda Bilimi Programı Başkanı (2026 Akademik Yılı)
- E-posta: nagano@cc.saga-u.ac.jp
- Kagoshima Üniversitesi Birleşik Tarım Bilimleri Lisansüstü Okulunda profesör (Kagoshima, Japonya)
- Misafir Profesör, Vishnu Institute of Pharmaceutical Education & Research (Narsapur, Telangana, India)
- Misafir Profesör, Shri Vishnu College of Pharmacy (Bhimavaram, Andhra Pradesh, India)
- Direktör, Smart Review Technologies Co., Ltd.
- Yayın Kurulu Üyesi (Genetik), Scientific Reports (Nature Portfolio), Dünyanın en çok atıf alan ikinci dergisi
- Yayın Kurulu Üyesi (Genetik), Scientific Reviews (Nature Portfolio)
- Başlıca Yayınlar
- Yayınlar
- Facebook (kişisel hesap; üniversite görevleri için kullanılmaz)
- GitHub: https://github.com/yukio-nagano
- Kiyohiko Seki
- Saga Üniversitesi Ziraat Fakültesinde öğretim görevlisi
Lisansüstü Öğrencileri
- Eranga Pawani Witharana
- Kagoshima Üniversitesi Birleşik Tarım Bilimleri Lisansüstü Okulunda ikinci yıl doktora öğrencisi (Saga Üniversitesine bağlı)
- Yayınlar
- GitHub: https://github.com/Eranga-Witharana/
Misafir Araştırmacı
- Durga Bhavani Koruprolu
- İkinci sınıf yüksek lisans öğrencisi, Shri Vishnu College of Pharmacy (Bhimavaram, Andhra Pradesh, India)
Lisans Öğrencileri
- Ayuka KawashitaSaga Üniversitesi Ziraat Fakültesinde dördüncü sınıf lisans öğrencisi
- Hiyori OshiroSaga Üniversitesi Ziraat Fakültesinde dördüncü sınıf lisans öğrencisi
- Riona NagatomoSaga Üniversitesi Ziraat Fakültesinde dördüncü sınıf lisans öğrencisi
- Takuma YamaguchiSaga Üniversitesi Ziraat Fakültesinde dördüncü sınıf lisans öğrencisi
En Son Araştırma
-
Kloroplast Genomiği
Kloroplast genomları “sabit planlar” değildir

-
Gıda Mikrobiyolojisi
Gıda üretiminde kullanılan bakterilerin genom analizi için yüksek verimli iş akışı

-
Bitki Genomiği
Aynı dizileme okumalarından çekirdek ve kloroplast DNA’sının analizi

Basın Bültenlerinde Öne Çıkan Çalışmalar
İşbirlikçi Araştırma Olanakları
Geliştirip yayımladığımız araştırma yöntemleri gıdayla ilişkili mikroorganizmalara odaklanarak genom analizini işlevsel değerlendirmeyle birleştirir. Yeni nesil dizileme (NGS) verilerini kullanarak gıda üretimi ve fermantasyonda rol alan gen gruplarını ve metabolik özellikleri moleküler düzeyde inceliyoruz. Ayrıca ökaryotik mikroorganizmalar için bir pangenom analiz yöntemi geliştiriyor ve EukPan programını şu GitHub repository içinde kullanıma sunuyoruz: yukio-nagano/eukpan. Bu yaklaşımları kullanarak Japonya'dan ve diğer ülkelerden araştırmacıları gıda biliminde temel araştırmalardan uygulamalı araştırmalara uzanan iş birliklerine davet ediyoruz.
geliştirdiğimiz ve yayınladığımız araştırma yöntemleri uygulanarak, yalnızca kamuya açık verileri kullanarak hayvanların ve bitkilerin moleküler evrimi hakkında akademik makaleler hazırlamak ve yayınlamak mümkündür. Bu yaklaşımı kullanarak Hindistan'daki araştırmacılarla halihazırda ortak araştırmalar yürütüyoruz ve şimdi bu araştırmayı daha da ilerletmek için hem Japonya'da hem de yurtdışında az sayıda ek ortak arıyoruz. Başvuru sahiplerinin İngilizce iletişim kurabilmeleri ve Linux çalıştıran bir bilgisayara erişim sahibi olmaları gerekmektedir.
Etkinlikler ve Güncellemeler
| 7 - 13 Eylül 2026 | Bir Sakura Science Exchange Program düzenledik. Hindistan’daki Sri Vishnu Educational Society bünyesinden bir öğretim üyesi ve yedi lisans öğrencisi Japonya’yı ziyaret etti. 21 Ağustos 2026 tarihinde bir ön basın duyurusu yayımladık. |
| 2 Eylül 2026 | Bugün, araştırma laboratuvarları gibi ekiplerin kullanımına yönelik bir plan olan ChatGPT Business'ı kullanmaya başladık. Ücreti araştırma fonlarından karşılanabildiği için bu ileri düzey AI aracını özellikle yetenekli ve araştırma motivasyonu yüksek lisansüstü öğrencilere sunarak araştırma faaliyetlerimizi daha da hızlandıracağız. Laboratuvarımız üstün başarılı öğrencilere aktif olarak yatırım yapmayı sürdürecektir. |
| 24 Ağustos 2026 | Peradeniya Üniversitesi (University of Peradeniya), aşağıdaki makalemizi Q1 Journal Publications kategorisinde ödüllendirdi. Subfamily evolution analysis using nuclear and chloroplast data from the same reads Eranga Pawani Witharana, Takaya Iwasaki, Myat Htoo San, Nadeeka U. Jayawardana, Nobuhiro Kotoda, Masashi Yamamoto & Yukio Nagano Scientific Reports 15, Article number: 687 (2025). Bu çalışmanın önemli bir bölümü Sri Lanka’daki Peradeniya Üniversitesinde yürütüldü. O sırada Yukio Nagano, Eranga Pawani Witharana’nın araştırmasını Japonya’dan uzaktan destekledi. Witharana daha sonra Japon Hükûmeti (MEXT) Bursu’nu kazanarak araştırma merkezini Japonya’ya taşıdı, çalışmayı sürdürdü ve bu makale olarak tamamladı. Dolayısıyla bu çalışma, Peradeniya Üniversitesindeki araştırma faaliyetlerinden açıkça doğmuş bir sonuçtur. Dr. Nadeeka U. Jayawardana ödül törenine araştırma grubumuzu temsilen katıldı. Peradeniya Üniversitesinin bu araştırma başarısını bu şekilde takdir etmesinden büyük mutluluk duyuyoruz. |
| 20 Ağustos 2026 | Yukio Nagano ve meslektaşları “Human-mediated domestic translocation disrupts regional phylogeographic structure of the Genji firefly (Nipponoluciola cruciata) in urban Tokyo” başlıklı makaleyi Conservation Genetics dergisinde yayımladı. Çalışma, insan aracılı yerel yer değiştirmenin, Tokyo kentindeki Genji ateşböceği popülasyonlarının bölgesel filocoğrafik yapısını bozduğunu gösteriyor. Bu çalışma, ateşböceklerinin araştırılması ve korunmasında Japonya'nın önde gelen uzmanlarından biri olan Dr. Hirobumi Suzuki ile birlikte yazılmıştır. 8 Eylül 2026 tarihinde Meisei Üniversitesi, Uluslararası Hristiyan Üniversitesi, Kagoshima Üniversitesi ve Saga Üniversitesi ortak basın açıklaması yayımladı (bilgiler yalnızca Japonca sunulmaktadır). |
| 30 Mart 2026 | Japon baş koordinatörü Yukio Nagano ve Hindistan baş koordinatörü Dr. Samudrala Pavan Kumar tarafından yönetilen ortak bir proje, Hindistan-Japonya Bilimde Yetenekli Gençlerin Dolaşımı Programı (LOTUS Programme) için seçildi idi. Dr. Kumar, Sri Vishnu Educational Society kapsamında Shri Vishnu College of Pharmacy (SVCP)'ye bağlıdır. Bu proje sayesinde SVCP'den Bayan Durga Bhavani Koruprolu, bugünden itibaren yaklaşık bir yıl boyunca laboratuvarımızda misafir araştırmacı olarak kalacak. Seçilen projelerin çoğu Hindistan Teknoloji Enstitülerini kapsadığından, bu seçim, araştırma çerçevemizin ve uluslararası işbirliğimizin kalitesinin özellikle kayda değer bir takdiridir. |
| 26 Mart 2026 | Seki ve Nagano, SAGA TSUNAGI Sözleşmesi (Japonca)'de sergilendi. |
| 5 Mart 2026 | Nagano ve meslektaşları Smart Review Technologies Co., Ltd.'yi kurdu ve Nagano şirketin yöneticisi oldu. |
| 24 Şubat 2026 | İlk yazarı Bayan Eranga Pawani Witharana olan, laboratuvarımızda bulunan bir araştırma grubu, Nucleic Acids Research'de [Dergi metrikleri: 2025 Journal Impact Factor: 15,0; 2025 5 yıllık Journal Impact Factor: 17,6; JCR Biyokimya ve Moleküler Biyoloji: 14/328; 2025 CiteScore: 29,8; Scopus Genetics: 5/357 (En üst %1,4); 2025 SNIP: 5.1 (Temmuz 2026 itibarıyla yayıncı tarafından listelenen en son metrikler)] ortak makale "Ongoing structural changes highlight the dynamic nature of chloroplast genomes"'yi yayınladı. Bilgiler Saga University press release, Kagoshima University press release(Japanese/English PDF) ve Kagoshima Üniversitesi Birleşik Tarım Bilimleri Lisansüstü Okulunun web sayfası aracılığıyla yayımlandı. Çevrimiçi makale mevcut olmasa da bu çalışma 20 Nisan 2026'da Minami-Nippon gazetesinde yayınlandı. |
| 2 - 13 Şubat 2026 | ve Sakura Science Exchange Program'ye ev sahipliği yaptık. Hindistan'daki Sri Vishnu Educational Society'den dört katılımcı ve Nepal'deki Tribhuvan Üniversitesi'den dört katılımcı Japonya'yı ziyaret etti. Ayrıca Hindistan'daki Sri Vishnu Educational Society kapsamındaki Vishnu Japan Outreach Centre Merkez Başkanı Dr. Raju AEDLA, Sakura Bilim Programından ayrı olarak Japonya'yı ziyaret etti. Saga University, bir basın bülteni (Japonca)'yi önceden yayınladı ve Saga Valiliği Hükümeti, 9 Şubat'ta Saga Eyaleti Valisine yapılan nezaket ziyaretiyle ilgili ayrı bir basın açıklaması (Japonca)'yi yayınladı. Farklı rollerini yansıtan Üniversitenin Uluslararası Planlama Ofisi ve Nagano'nun her biri bir program sonrası rapor yayınladı ( eski ve ikinci (sırasıyla). |
| 17 Aralık 2025 | Seki ve Nagano, ortak yazarlı “Conserved accessory genes link a phylogenetically distinct Bacillus subtilis strain from Indian bekang to the Japanese natto clade” makalesini Scientific Reports'de yayımladı [Dergi metrikleri: 2025 Journal Impact Factor: 4.9; 2025 5-year Journal Impact Factor: 4.8; 2025 SNIP: 1.339; 2025 SJR: 0.893; dünyanın en çok atıf alan ikinci dergisi (Temmuz 2026 itibarıyla yayıncının açıkladığı en güncel metrikler)]. Nagano ayrıca bir tanıtım yazısı yazdı ve Saga University bir English-language press release yayımladı. İlk sayfadaki fotoğraf görsel aramada “natto” olarak tanımlanabilir, ancak aslında Bekang'ı göstermektedir. Çalışma 14 Ocak 2026'da Saga Gazetesi(Japonca)'nde ve 10 Şubat 2026'da yayımlanan Kodomo no Kagaku(Japonca)'nun Mart 2026 sayısında yer aldı. |
| 2 - 5 Aralık 2025 | Eranga Pawani Witharana, 2 Aralık'ta Ochanomizu Üniversitesi Fen Fakültesi'nde Dr. Takaya Iwasaki’nin laboratuvarı'de ve 3-5 Aralık tarihleri arasında Pacifico Yokohama'da düzenlenen Japonya Moleküler Biyoloji Topluluğu Yıllık Toplantısında bir'de bir seminer verdi. |
| 21 Ekim 2025 | Nagano'nun röportajı, Vishnu Era – SVES Quarterly News Magazine'in Temmuz 2025 sayısının 7. sayfasında yayımlandı. |
| 18 - 29 Eylül 2025 | Saga Üniversitesi Ziraat Fakültesi ile Hindistan’daki Sri Vishnu Educational Society bünyesindeki Vishnu Japan Outreach Centre arasında akademik değişim anlaşması imzalamak üzere Nagano, Ziraat Fakültesi Dekanı Suzuki ile birlikte Hindistan’ı ziyaret etti. Ayrıntılar için press release’ye bakınız. Ziyaret sırasında Hint araştırma ekibinin üyeleriyle ortak araştırmalar da yürütüldü. Bu fotoğraf, yeni kurulan Bitki Genomu Araştırma Merkezini gösteriyor. |
| 19 Ağustos 2025 | Nagano ve meslektaşları, ortak yazarlı “ Çift sindirim kısıtlama bölgesiyle ilişkili DNA dizilimi " makalesini Animal Genetics'de yayınladılar [Dergi ölçümleri: Journal Impact Factor: 2.2; CiteScore: 4.0 (Temmuz 2026 itibarıyla yayıncı tarafından listelenen en son ölçümler)]. İlk yazar Dr. Su Lai Yee Mon'dur. 29 Eylül - 3 Ekim 2020 tarihleri arasında Saga University'de kaldı ve bu süre zarfında bu çalışmanın veri analizinin bir kısmını gerçekleştirdi. |
| 1 Temmuz 2025 | Nagano, Vishnu Institute of Pharmaceutical Education & Research (Narsapur, Telangana, India) ve Shri Vishnu College of Pharmacy (Bhimavaram, Andhra Pradesh, India)'de Misafir Profesör olarak atandı. Üç yıllık görevlendirmeler 30 Haziran 2028'e kadar sürecek. Şifalı bitkiler konusunda ortak araştırma yapacağız. |
| 29 Mayıs 2025 | Nagano, Springer Nature Editor of Distinction Awards 2025 kapsamında iki ödül aldı: Scientific Reports'a katkılarından dolayı Editorial Contribution Award ve Scientific Reports'a katkılarından dolayı Author Service Award. Saga University 10 Haziran'da bir press release yayımladı. |
| 23 Mayıs 2025 | Seki ve Nagano “Draft genome sequence of Agarivorans albus strain S3 capable of utilizing nori as a nutrient source” makalesini Microbiology Resource Announcements'de yayınladılar. Bu onların laboratuvarımızdaki ilk ortak araştırma makalesidir. |
| 16 Mayıs 2025 | İşbirlikçimiz Bay Fukuda hakkında bir gazete makalesi (Japonca) yayınlandı. Mart 2025'te Chienkan Lisesi'nden mezun oldu ve sonbaharda Washington Üniversitesi'ne kaydolmayı planladı. |
| 12 Mayıs 2025 | " Metagenomic analysis reveals fuzzy bacterial communities potentially supporting Pyropia yezoensis through vitamin B12 and indole acetic acid biosynthesis " makalesini Phycological Research'de yayınladık [Dergi ölçümleri: Journal Impact Factor: 1,0; CiteScore: 3,3 (Temmuz 2026 itibarıyla yayıncı tarafından listelenen en son ölçümler)]. İlk yazar, daha önce Saga University'de bulunan ve şu anda Mie Üniversitesi'nde araştırma yürüten Dr. Yukino Mizutani'dir. |
| 21 Nisan 2025 | Google Scholar'ye göre Nagano'nun yayınları 3.000 alıntıyı aştı. |
| 10 Nisan 2025 | “Identification of new resistance QTL regions in loquat cultivar ‘Champagne’ against Pseudomonas syringae pv. eriobotryae group C” makalesini Tree Genetics & Genomes'de yayınladık [Dergi ölçümleri: 2025 Journal Impact Factor: 2.1; 2025 5 yıllık Journal Impact Factor: 2,1 (Temmuz 2026 itibarıyla yayıncı tarafından listelenen en son ölçümler)]. İlk yazar, Dr. Shinji Fukuda ve Dr. Nagano tarafından ortak denetlenen Bay Shogo Koga'dir. |
| 7 Nisan 2025 | Dr. Shinji Fukuda ve Dr. Nagano'nun birlikte denetlediği Bay Shogo Koga, Japon Bahçe Bitkileri Bilimi Derneği FY2025 Bahar Toplantısında Üstün Genç Sunum Ödülü (Japonca)'yi aldı. Bu, ödülü aldığı üst üste ikinci yıl oldu. |
| 1 Nisan 2025 | Yukio Nagano, Saga University Analytical Research Center for Experimental Sciences(Japonca)'dan laboratuvarımıza katıldı. Eranga Pawani Witharana (Sri Lanka) doktora programına başladı. Myat Htoo San (Myanmar), 2024 mali yılında Saga University Analytical Research Center for Experimental Sciences(Japonca)'da Dr. Nagano'nun danışmanlığında doktorasını tamamladıktan sonra National Institute of Advanced Industrial Science and Technology'ye tam zamanlı, daimi araştırmacı olarak katıldı. Dr. Nagano'nun Nagoya Üniversitesi Ziraat Fakültesinde danışmanlığını yaptığı Takehito Inaba, Miyazaki Üniversitesi Ziraat Fakültesine profesör olarak atandı. |