Filosofi

“民以食為天” (“Bagi rakyat, pangan adalah kebutuhan utama”) — Pangan adalah landasan yang menopang kehidupan dan membangun masyarakat.
Kami mengkaji hakikatnya melalui ilmu pengetahuan.

Tentang Laboratorium Kami

Kami menyelenggarakan pendidikan dan penelitian tentang bahan pangan dari sudut pandang kimia. Dengan mengembangkan pengalaman kami dalam mengidentifikasi enzim pengurai karbohidrat dan menerapkannya pada bahan pangan, serta riset kimia pangan berbasis genomik, kami akan mengintegrasikan model bahasa genom, model bahasa protein, dan model bahasa kimia ke dalam ilmu pangan. Dengan menganalisis informasi biologis dan molekuler lintas bahan pangan, tanaman, dan mikroorganisme, kami bertujuan mempercepat penemuan serta pemanfaatan enzim, mikroorganisme, sumber daya tanaman, dan komponen pangan untuk mendorong inovasi dalam ilmu pangan.

Integrasi informasi DNA, protein, dan kimia menggunakan tumbuhan, mikroorganisme, dan bahan makanan

Di Amerika Serikat, seiring meluasnya penggunaan obat antiobesitas, perhatian terhadap pangan padat gizi yang tetap dapat memenuhi kebutuhan zat gizi penting ketika asupan berkurang semakin meningkat. Pasarnya di Jepang masih terbatas; namun, mengingat kekurangan gizi akibat penuaan penduduk, berat badan rendah pada perempuan muda, dan kemungkinan makin luasnya penggunaan obat antiobesitas, penanganan malnutrisi khas negara maju akan menjadi semakin penting. Karena itu, kami akan mendorong penelitian pangan padat gizi. Nori dan natto yang telah lama kami teliti merupakan objek penelitian yang menjanjikan.

Makanan padat nutrisi termasuk nori, natto, biji-bijian, dan sayuran berdaun

Anggota

Dosen

Mahasiswa Pascasarjana

Peneliti Tamu

Mahasiswa Sarjana

Penelitian Terbaru

Penelitian yang Dimuat dalam Siaran Pers

Peluang Riset Kolaboratif

Metode penelitian yang kami kembangkan dan publikasikan mengintegrasikan analisis genom dengan evaluasi fungsional, dengan fokus pada mikroorganisme terkait pangan. Berdasarkan data sekuensing generasi berikutnya (NGS), kami menganalisis kelompok gen dan karakteristik metabolik yang terlibat dalam produksi serta fermentasi pangan pada tingkat molekuler. Kami juga sedang mengembangkan metode analisis pangenom untuk mikroorganisme eukariotik dan telah membuka program EukPan untuk publik melalui repositori GitHub yukio-nagano/eukpan. Kami mengundang kolaborasi dari dalam dan luar negeri, mulai dari penelitian dasar hingga terapan di bidang ilmu pangan yang menggunakan metode tersebut.

Dengan menggunakan metode penelitian yang kami kembangkan dan publikasikan, artikel ilmiah mengenai evolusi molekuler hewan dan tumbuhan dapat disusun dan diterbitkan hanya dari data yang tersedia untuk publik. Kami telah menjalankan kolaborasi dengan peneliti India menggunakan pendekatan ini dan kini mencari sejumlah kecil mitra di Jepang maupun luar negeri untuk mengembangkan riset lebih lanjut. Pelamar harus mampu berkomunikasi ilmiah dalam bahasa Inggris dan memiliki akses ke komputer yang menjalankan Linux.

Kegiatan dan Informasi Terbaru

7 hingga 13 September 2026 Kami telah menyelenggarakan Sakura Science Exchange Program. Seorang dosen dan tujuh mahasiswa sarjana dari Sri Vishnu Educational Society di India telah berkunjung ke Jepang. Pada 21 Agustus 2026, kami menerbitkan siaran pers pendahuluan.
2 September 2026Hari ini kami mulai menggunakan ChatGPT Business, paket yang dirancang untuk tim seperti laboratorium penelitian. Karena biayanya dapat dibayarkan dari dana penelitian, kami akan menyediakan perangkat AI canggih ini khususnya bagi mahasiswa pascasarjana yang sangat berprestasi dan bermotivasi tinggi, sehingga kegiatan penelitian kami dapat dipercepat lebih lanjut. Laboratorium kami akan terus aktif berinvestasi pada mahasiswa berprestasi.
24 Agustus 2026Universitas Peradeniya (University of Peradeniya) memberikan penghargaan kepada makalah kami berikut ini dalam kategori Q1 Journal Publications.
Subfamily evolution analysis using nuclear and chloroplast data from the same reads
Eranga Pawani Witharana, Takaya Iwasaki, Myat Htoo San, Nadeeka U. Jayawardana, Nobuhiro Kotoda, Masashi Yamamoto & Yukio Nagano
Scientific Reports 15, Article number: 687 (2025).
Bagian penting penelitian ini dilaksanakan di Universitas Peradeniya, Sri Lanka. Pada saat itu, Yukio Nagano mendukung penelitian Eranga Pawani Witharana dari Jepang secara jarak jauh. Ia kemudian memperoleh Beasiswa Pemerintah Jepang (MEXT), memindahkan basis penelitiannya ke Jepang, melanjutkan penelitian, dan menyelesaikannya sebagai artikel ini. Karena itu, karya ini juga jelas merupakan hasil kegiatan penelitian di Universitas Peradeniya. Dr. Nadeeka U. Jayawardana menghadiri upacara penghargaan mewakili kelompok penelitian kami. Kami sangat senang Universitas Peradeniya mengakui pencapaian penelitian ini dengan cara tersebut.
20 Agustus 2026 Yukio Nagano dan rekan-rekannya menerbitkan artikel “Human-mediated domestic translocation disrupts regional phylogeographic structure of the Genji firefly (Nipponoluciola cruciata) in urban Tokyo” di Conservation Genetics. Penelitian menunjukkan bahwa pemindahan domestik oleh manusia telah mengganggu struktur filogeografi regional populasi Genji firefly di perkotaan Tokyo. Dr. Hirobumi Suzuki, salah satu pakar terkemuka Jepang dalam penelitian dan konservasi kunang-kunang, merupakan salah satu penulisnya. Pada 8 September 2026, Universitas Meisei, Universitas Kristen Internasional, Universitas Kagoshima, dan Universitas Saga menerbitkan siaran pers bersama (informasi hanya tersedia dalam bahasa Jepang).
30 Maret 2026 Proyek bersama yang dipimpin Yukio Nagano sebagai principal coordinator Jepang dan Dr. Samudrala Pavan Kumar sebagai principal coordinator India terpilih dalam India–Japan Circulation of Talented Youths in Science Programme (LOTUS Programme). Dr. Kumar berafiliasi dengan Shri Vishnu College of Pharmacy (SVCP) di bawah Sri Vishnu Educational Society. Melalui proyek ini, Durga Bhavani Koruprolu dari SVCP akan menjadi visiting researcher di laboratorium kami selama sekitar satu tahun mulai hari ini. Karena banyak proyek terpilih melibatkan Indian Institutes of Technology, hasil ini merupakan pengakuan penting terhadap mutu sistem penelitian dan kolaborasi internasional kami.
26 Maret 2026 Seki dan Nagano membuka stan pameran di SAGA TSUNAGI Convention(dalam bahasa Jepang).
5 Maret 2026 Nagano dan rekan-rekannya mendirikan Smart Review Technologies Co., Ltd., dan Nagano menjadi direktur perusahaan tersebut.
24 Februari 2026 Kelompok penelitian yang berpusat di laboratorium kami, dengan Eranga Pawani Witharana sebagai penulis pertama, menerbitkan makalah kolaboratif berjudul “Ongoing structural changes highlight the dynamic nature of chloroplast genomes” di Nucleic Acids Research. [Indikator evaluasi jurnal: 2025 Journal Impact Factor: 15.0; 2025 5-year Journal Impact Factor: 17.6; JCR Biochemistry & Molecular Biology: 14/328; 2025 CiteScore: 29.8; Scopus Genetics: 5/357 (Top 1.4%); 2025 SNIP: 5.1 (nilai terbaru yang dicantumkan penerbit per Juli 2026)]. Informasi tersebut diumumkan melalui Saga University press release, Kagoshima University press release(Japanese/English PDF), dan Laman Sekolah Pascasarjana Bersama Ilmu Pertanian, Universitas Kagoshima. Meskipun tidak ada artikel daring, penelitian ini juga dimuat dalam surat kabar Minami-Nippon edisi 20 April 2026.
2 hingga 13 Februari 2026 Kami telah menyelenggarakan Sakura Science Exchange Program. Empat peserta dari Sri Vishnu Educational Society di India dan empat peserta dari Tribhuvan University di Nepal berkunjung ke Jepang. Selain itu, Dr. Raju AEDLA, Centre Head Vishnu Japan Outreach Centre di bawah Sri Vishnu Educational Society di India, juga berkunjung ke Jepang secara terpisah dari program Sakura Science. Saga University menerbitkan siaran pers pendahuluan(dalam bahasa Jepang); Saga Prefectural Government menerbitkan siaran pers terpisah(dalam bahasa Jepang) mengenai kunjungan kehormatan kepada Gubernur Saga Prefecture pada 9 Februari. Sesuai peran masing-masing, laporan pascaprogram University International Planning Office dan laporan Nagano diterbitkan secara terpisah.
17 Desember 2025 Seki dan Nagano menerbitkan makalah kolaboratif berjudul “Conserved accessory genes link a phylogenetically distinct Bacillus subtilis strain from Indian bekang to the Japanese natto clade” di Scientific Reports. [Indikator evaluasi jurnal: 2025 Journal Impact Factor: 4.9; 2025 5-year Journal Impact Factor: 4.8; 2025 SNIP: 1.339; 2025 SJR: 0.893; jurnal kedua yang paling banyak disitasi di dunia (nilai terbaru yang dicantumkan penerbit per Juli 2026)]. Nagano juga menulis artikel latar belakang penelitian, dan Saga University menerbitkan English-language press release. Foto pada halaman pertama siaran pers itu mungkin dikenali sebagai “natto” melalui pencarian gambar, tetapi sebenarnya menampilkan Bekang. Penelitian ini dimuat dalam surat kabar Saga(dalam bahasa Jepang) edisi 14 Januari 2026 dan dalam edisi Maret 2026 Kodomo no Kagaku(dalam bahasa Jepang), yang terbit pada 10 Februari 2026.
2 hingga 5 Desember 2025 Pada 2 Desember, Eranga Pawani Witharana memberikan seminar di Dr. Takaya Iwasaki’s laboratory, Faculty of Science, Ochanomizu University, lalu mempresentasikan poster pada pertemuan tahunan Molecular Biology Society of Japan di Pacifico Yokohama, 3–5 Desember.
21 Oktober 2025 Wawancara Nagano dimuat pada halaman 7 dalam edisi Juli 2025 Vishnu Era – SVES Quarterly News Magazine.
18 hingga 29 September 2025 Untuk menindaklanjuti academic exchange agreement antara Fakultas Pertanian Universitas Saga dan Vishnu Japan Outreach Centre di bawah Sri Vishnu Educational Society, India, Nagano mengunjungi India bersama Faculty Dean Suzuki. Rincian tersedia dalam press release. Selama kunjungan, penelitian bersama juga dilakukan dengan anggota tim peneliti India. Foto ini menampilkan pusat baru untuk plant-genome research.
19 Agustus 2025 Nagano dan rekannya menerbitkan makalah yang ditulis bersama “Exploring genetic diversity and population structure of Myanmar indigenous chickens using double digest restriction site-associated DNA sequencing" di Animal Genetics [Metrik jurnal: Journal Impact Factor: 2.2; CiteScore: 4.0 (metrik terbaru yang tercantum dalam daftar penerbit per Juli 2026)]. Penulis pertama adalah Dr. Su Lai Yee Mon. Dia tinggal di Universitas Saga dari tanggal 29 September hingga 3 Oktober 2020, di mana dia melakukan sebagian analisis data untuk penelitian ini.
1 Juli 2025 Nagano ditunjuk sebagai Visiting Professor di Vishnu Institute of Pharmaceutical Education & Research (Narsapur, Telangana, India) dan Shri Vishnu College of Pharmacy (Bhimavaram, Andhra Pradesh, India). Masa jabatan tiga tahun berlangsung hingga 30 Juni 2028. Kami akan melakukan penelitian bersama tentang tanaman obat.
29 Mei 2025 Nagano menerima dua penghargaan pada Springer Nature Editor of Distinction Awards 2025 atas kontribusinya kepada Scientific Reports, yaitu Editorial Contribution Award dan Author Service Award. Saga University menerbitkan siaran pers pada 10 Juni.
23 Mei 2025 Seki dan Nagano menerbitkan makalah “Draft genome sequence of Agarivorans albus strain S3 capable of utilizing nori as a nutrient source” di Microbiology Resource Announcements. Ini adalah makalah penelitian bersama pertama mereka dari laboratorium kami.
16 Mei 2025 artikel surat kabar tentang kolaborator kami, Mr. Fukuda(dalam bahasa Jepang), diterbitkan. Dia lulus dari Sekolah Menengah Chienkan pada Maret 2025 dan berencana mendaftar di Universitas Washington pada musim gugur itu.
12 Mei 2025 Kami menerbitkan makalah “Metagenomic analysis reveals fuzzy bacterial communities potentially supporting Pyropia yezoensis through vitamin B12 and indole acetic acid biosynthesis" di Phycological Research [Metrik jurnal: Journal Impact Factor: 1.0; CiteScore: 3.3 (metrik terbaru yang tercantum dalam daftar penerbit per Juli 2026)]. Penulis pertama adalah Dr. Yukino Mizutani, yang sebelumnya berada di Saga University dan saat ini sedang melakukan penelitian di Mie University.
21 April 2025 Menurut Google Scholar, Publikasi Nagano melampaui 3.000 kutipan.
10 April 2025 Kami menerbitkan makalah “Identification of new resistance QTL regions in loquat cultivar ‘Champagne’ against Pseudomonas syringae pv. eriobotryae group C” di Tree Genetics & Genomes [Metrik jurnal: 2025 Journal Impact Factor: 2.1; 2025 5-year Journal Impact Factor: 2.1 (metrik terbaru yang tercantum dalam daftar penerbit per Juli 2026)]. Penulis pertama adalah Mr. Shogo Koga, yang dibimbing oleh Dr. Shinji Fukuda dan Dr. Nagano.
7 April 2025 Mr. Shogo Koga, yang dibimbing bersama oleh Dr. Shinji Fukuda dan Dr. Nagano, menerima Penghargaan Presentasi Unggul Peneliti Muda pada Pertemuan Musim Semi FY2025 Japanese Society for Horticultural Science(dalam bahasa Jepang). Ini merupakan tahun kedua berturut-turut ia menerima penghargaan tersebut.
1 April 2025 Yukio Nagano bergabung dengan laboratorium kami setelah bertugas di Saga University’s Analytical Research Center for Experimental Sciences(dalam bahasa Jepang). Eranga Pawani Witharana dari Sri Lanka memasuki program doktor. Dr. Myat Htoo San dari Myanmar, yang memperoleh PhD pada tahun fiskal 2024 di pusat tersebut di bawah bimbingan Dr. Nagano, bergabung dengan National Institute of Advanced Industrial Science and Technology sebagai peneliti tetap penuh waktu. Dr. Takehito Inaba, yang pernah dibimbing Dr. Nagano di Fakultas Pertanian Universitas Nagoya, diangkat sebagai Professor di Fakultas Pertanian Universitas Miyazaki.
Ilustrasi potret Profesor Yukio Nagano

Yukio Nagano